Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP1P48552 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms