Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IQGAP1P46940 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC30.07■■■□□ 2.41
IQGAP1P46940 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
IQGAP1P46940 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms