Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH1P40692 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH1P40692 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH1P40692 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH1P40692 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH1P40692 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH1P40692 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH1P40692 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH1P40692 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH1P40692 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH1P40692 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH1P40692 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH1P40692 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH1P40692 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH1P40692 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH1P40692 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLH1P40692 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH1P40692 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH1P40692 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH1P40692 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH1P40692 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH1P40692 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH1P40692 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH1P40692 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH1P40692 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH1P40692 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH1P40692 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH1P40692 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH1P40692 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH1P40692 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH1P40692 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH1P40692 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH1P40692 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH1P40692 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH1P40692 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLH1P40692 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLH1P40692 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH1P40692 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH1P40692 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH1P40692 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH1P40692 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH1P40692 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH1P40692 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH1P40692 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH1P40692 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH1P40692 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH1P40692 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH1P40692 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH1P40692 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH1P40692 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH1P40692 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH1P40692 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH1P40692 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH1P40692 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH1P40692 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH1P40692 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH1P40692 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH1P40692 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH1P40692 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH1P40692 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH1P40692 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH1P40692 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH1P40692 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH1P40692 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH1P40692 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH1P40692 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH1P40692 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH1P40692 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MLH1P40692 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MLH1P40692 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms