Protein–RNA interactions for Protein: P40462

TMA108, Protein TMA108, yeast

Predictions only

Length 946 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TMA108	P40462	VPS63	YLR261C	327 nt		3.16	□□□□□ -1.9
TMA108	P40462	YLR271W	YLR271W	825 nt		3.16	□□□□□ -1.9
TMA108	P40462	Q0017	Q0017	162 nt		3.16	□□□□□ -1.9
TMA108	P40462	NET1	YJL076W	3570 nt		3.16	□□□□□ -1.9
TMA108	P40462	SHS1	YDL225W	1656 nt		3.16	□□□□□ -1.9
TMA108	P40462	YDR338C	YDR338C	2088 nt		3.16	□□□□□ -1.9
TMA108	P40462	ECM21	YBL101C	3354 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YDR042C	YDR042C	603 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	tC(GCA)B	tC(GCA)B	72 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	tC(GCA)G	tC(GCA)G	72 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	tC(GCA)P1	tC(GCA)P1	72 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	tC(GCA)P2	tC(GCA)P2	72 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	tF(GAA)D	tF(GAA)D	73 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	tF(GAA)N	tF(GAA)N	73 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YER091C-A	YER091C-A	222 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	ASG7	YJL170C	630 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	RCN1	YKL159C	636 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	SDO1	YLR022C	753 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	AIM36	YMR157C	768 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YBR051W	YBR051W	351 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	AFT2	YPL202C	1251 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	snR191	snR191	274 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	POM152	YMR129W	4014 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YFL002W-B	YFL002W-B	1317 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YGR161W-A	YGR161W-A	1317 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YBL100W-A	YBL100W-A	1317 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YCL020W	YCL020W	1317 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	JJJ1	YNL227C	1773 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YPL216W	YPL216W	3309 nt		3.14	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	TSC11	YER093C	4293 nt		3.14	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	BMH2	YDR099W	822 nt		3.14	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	TIM11	YDR322C-A	291 nt		3.14	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	PPX1	YHR201C	1194 nt		3.14	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YLR012C	YLR012C	300 nt		3.14	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YNR025C	YNR025C	360 nt		3.14	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	ARL3	YPL051W	597 nt		3.14	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	SSP1	YHR184W	1716 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	USE1	YGL098W	738 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YIP1	YGR172C	747 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	RPL17B	YJL177W	555 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	SDS22	YKL193C	1017 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YRO2	YBR054W	1035 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YBR062C	YBR062C	543 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YPR153W	YPR153W	423 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	PCK1	YKR097W	1650 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YCT1	YLL055W	1596 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YDL180W	YDL180W	1644 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	STE6	YKL209C	3873 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	TMA64	YDR117C	1698 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	DAD1	YDR016C	285 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YKL091C	YKL091C	933 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	RIM9	YMR063W	720 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	NMA111	YNL123W	2994 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	HSP10	YOR020C	321 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YBR063C	YBR063C	1215 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	DOA4	YDR069C	2781 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YKL222C	YKL222C	2118 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	PBP4	YDL053C	558 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	MND1	YGL183C	660 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	ERV1	YGR029W	570 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YGR053C	YGR053C	852 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YJL147C	YJL147C	1149 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	SDH3	YKL141W	597 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	SEC14	YMR079W	915 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YOR152C	YOR152C	771 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	AI2	Q0055	2565 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	SLF1	YDR515W	1344 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	VHR1	YIL056W	1923 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	HEH2	YDR458C	1992 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	FLO1	YAR050W	4614 nt		3.1	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YEL1	YBL060W	2064 nt		3.1	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YCR090C	YCR090C	549 nt		3.1	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	PPH3	YDR075W	927 nt		3.1	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YKL123W	YKL123W	381 nt		3.1	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	APC9	YLR102C	798 nt		3.1	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	CWC24	YLR323C	780 nt		3.1	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	RRT16	YNL105W	429 nt		3.1	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YAP7	YOL028C	738 nt		3.1	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	POL2	YNL262W	6669 nt		3.1	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	UTP15	YMR093W	1542 nt		3.09	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	SPO71	YDR104C	3738 nt		3.09	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	MRH1	YDR033W	963 nt		3.09	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YMR31	YFR049W	372 nt		3.09	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YGL082W	YGL082W	1146 nt		3.09	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YHL005C	YHL005C	393 nt		3.09	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	FRE2	YKL220C	2136 nt		3.09	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	COX8	YLR395C	237 nt		3.09	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YNL013C	YNL013C	378 nt		3.09	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	HEM4	YOR278W	828 nt		3.09	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	YPR014C	YPR014C	330 nt		3.09	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	PIS1	YPR113W	663 nt		3.09	□□□□□ -1.91
TMA108	P40462	UBX3	YDL091C	1368 nt		3.09	□□□□□ -1.92
TMA108	P40462	RSN1	YMR266W	2862 nt		3.09	□□□□□ -1.92
TMA108	P40462	SCY1	YGL083W	2415 nt		3.08	□□□□□ -1.92
TMA108	P40462	YHR213W	YHR213W	597 nt		3.08	□□□□□ -1.92
TMA108	P40462	TDA8	YAL064C-A	381 nt		3.08	□□□□□ -1.92
TMA108	P40462	YAR062W	YAR062W	597 nt		3.08	□□□□□ -1.92
TMA108	P40462	YBL065W	YBL065W	345 nt		3.08	□□□□□ -1.92
TMA108	P40462	GIM3	YNL153C	390 nt		3.08	□□□□□ -1.92
TMA108	P40462	YLR446W	YLR446W	1302 nt		3.08	□□□□□ -1.92

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