Protein–RNA interactions for Protein: P38137

PCS60, Peroxisomal-coenzyme A synthetase, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PCS60P38137 HSP104YLL026W 2727 nt5.49□□□□□ -1.53
PCS60P38137 YSW1YBR148W 1830 nt5.49□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PCS60P38137 EMI1YDR512C 564 nt5.49□□□□□ -1.53
PCS60P38137 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt5.49□□□□□ -1.53
PCS60P38137 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt5.49□□□□□ -1.53
PCS60P38137 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt5.49□□□□□ -1.53
PCS60P38137 PET191YJR034W 327 nt5.49□□□□□ -1.53
PCS60P38137 YDL199CYDL199C 2064 nt5.49□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PCS60P38137 ICR1ICR1 3199 nt5.49□□□□□ -1.53
PCS60P38137 SIP1YDR422C 2448 nt5.48□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PCS60P38137 LYS2YBR115C 4179 nt5.48□□□□□ -1.53
PCS60P38137 CTT1YGR088W 1689 nt5.48□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PCS60P38137 VPS73YGL104C 1461 nt5.48□□□□□ -1.53
PCS60P38137 YER066C-AYER066C-A 501 nt5.48□□□□□ -1.53
PCS60P38137 YGR164WYGR164W 336 nt5.48□□□□□ -1.53
PCS60P38137 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt5.48□□□□□ -1.53
PCS60P38137 PRE8YML092C 753 nt5.48□□□□□ -1.53
PCS60P38137 SWI3YJL176C 2478 nt5.48□□□□□ -1.53
PCS60P38137 SPC72YAL047C 1869 nt5.47□□□□□ -1.53
PCS60P38137 FKH2YNL068C 2589 nt5.47□□□□□ -1.53
PCS60P38137 BNA4YBL098W 1383 nt5.47□□□□□ -1.53
PCS60P38137 HOP1YIL072W 1818 nt5.47□□□□□ -1.53
PCS60P38137 IRC4YDR540C 540 nt5.47□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PCS60P38137 YLR230WYLR230W 306 nt5.47□□□□□ -1.53
PCS60P38137 YDR338CYDR338C 2088 nt5.47□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PCS60P38137 RNA14YMR061W 2034 nt5.47□□□□□ -1.53
PCS60P38137 MCM2YBL023C 2607 nt5.46□□□□□ -1.53
PCS60P38137 YCK2YNL154C 1641 nt5.46□□□□□ -1.54
PCS60P38137 SNA4YDL123W 423 nt5.46□□□□□ -1.54
PCS60P38137 RPA12YJR063W 378 nt5.46□□□□□ -1.54
PCS60P38137 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt5.46□□□□□ -1.54
PCS60P38137 TAR1YLR154W-C 375 nt5.46□□□□□ -1.54
PCS60P38137 EXO1YOR033C 2109 nt5.46□□□□□ -1.54
PCS60P38137 ACC1YNR016C 6702 nt5.46□□□□□ -1.54
PCS60P38137 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt5.45□□□□□ -1.54
PCS60P38137 ERG28YER044C 447 nt5.45□□□□□ -1.54
PCS60P38137 YGL042CYGL042C 306 nt5.45□□□□□ -1.54
PCS60P38137 YIL032CYIL032C 357 nt5.45□□□□□ -1.54
PCS60P38137 GPP1YIL053W 753 nt5.45□□□□□ -1.54
PCS60P38137 HUB1YNR032C-A 222 nt5.45□□□□□ -1.54
PCS60P38137 PIS1YPR113W 663 nt5.45□□□□□ -1.54 RIP-Chip
PCS60P38137 IZH3YLR023C 1632 nt5.45□□□□□ -1.54
PCS60P38137 OSW7YFR039C 1533 nt5.44□□□□□ -1.54
PCS60P38137 RRT13YER066W 558 nt5.44□□□□□ -1.54 RIP-Chip
PCS60P38137 MVB12YGR206W 306 nt5.44□□□□□ -1.54
PCS60P38137 YJL135WYJL135W 318 nt5.44□□□□□ -1.54
PCS60P38137 GPI14YJR013W 1212 nt5.44□□□□□ -1.54
PCS60P38137 TMA10YLR327C 261 nt5.44□□□□□ -1.54
PCS60P38137 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt5.44□□□□□ -1.54
PCS60P38137 HSP10YOR020C 321 nt5.44□□□□□ -1.54
PCS60P38137 RKM1YPL208W 1752 nt5.44□□□□□ -1.54
PCS60P38137 SKG3YLR187W 3081 nt5.44□□□□□ -1.54
PCS60P38137 FRT2YAL028W 1587 nt5.43□□□□□ -1.54 RIP-Chip
PCS60P38137 PDI1YCL043C 1569 nt5.43□□□□□ -1.54
PCS60P38137 TRX3YCR083W 384 nt5.43□□□□□ -1.54
PCS60P38137 YDR340WYDR340W 303 nt5.43□□□□□ -1.54
PCS60P38137 SIP2YGL208W 1248 nt5.43□□□□□ -1.54
PCS60P38137 OST6YML019W 999 nt5.43□□□□□ -1.54
PCS60P38137 RHO2YNL090W 579 nt5.43□□□□□ -1.54
PCS60P38137 snR35snR35 204 nt5.43□□□□□ -1.54
PCS60P38137 SLM6YBR266C 453 nt5.43□□□□□ -1.54
PCS60P38137 SKM1YOL113W 1968 nt5.43□□□□□ -1.54
PCS60P38137 YDL180WYDL180W 1644 nt5.42□□□□□ -1.54
PCS60P38137 PTR3YFR029W 2037 nt5.42□□□□□ -1.54
PCS60P38137 LPP1YDR503C 825 nt5.42□□□□□ -1.54
PCS60P38137 YGR242WYGR242W 309 nt5.42□□□□□ -1.54
PCS60P38137 YJL150WYJL150W 303 nt5.42□□□□□ -1.54
PCS60P38137 CWC24YLR323C 780 nt5.42□□□□□ -1.54
PCS60P38137 RIM101YHL027W 1878 nt5.42□□□□□ -1.54 RIP-Chip
PCS60P38137 YIR007WYIR007W 2295 nt5.42□□□□□ -1.54
PCS60P38137 RAD61YDR014W 1944 nt5.42□□□□□ -1.54
PCS60P38137 ROG3YFR022W 2202 nt5.42□□□□□ -1.54 RIP-Chip
PCS60P38137 PRP39YML046W 1890 nt5.41□□□□□ -1.54
PCS60P38137 RPS8BYER102W 603 nt5.41□□□□□ -1.54
PCS60P38137 IKS1YJL057C 2004 nt5.41□□□□□ -1.54
PCS60P38137 MCM6YGL201C 3054 nt5.41□□□□□ -1.54
PCS60P38137 ASI1YMR119W 1875 nt5.41□□□□□ -1.54
PCS60P38137 YER158CYER158C 1722 nt5.4□□□□□ -1.54
PCS60P38137 ALG13YGL047W 609 nt5.4□□□□□ -1.54 RIP-Chip
PCS60P38137 CAX4YGR036C 720 nt5.4□□□□□ -1.54
PCS60P38137 YHR212CYHR212C 336 nt5.4□□□□□ -1.54
PCS60P38137 SGN1YIR001C 753 nt5.4□□□□□ -1.54
PCS60P38137 PSY1YKL076C 384 nt5.4□□□□□ -1.54
PCS60P38137 YAR060CYAR060C 336 nt5.4□□□□□ -1.54
PCS60P38137 YLR001CYLR001C 2589 nt5.39□□□□□ -1.55
PCS60P38137 PEX6YNL329C 3093 nt5.39□□□□□ -1.55 RIP-Chip
PCS60P38137 HTL1YCR020W-B 237 nt5.39□□□□□ -1.55
PCS60P38137 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt5.39□□□□□ -1.55
PCS60P38137 SPC19YDR201W 498 nt5.39□□□□□ -1.55 RIP-Chip
PCS60P38137 YGL052WYGL052W 306 nt5.39□□□□□ -1.55
PCS60P38137 IRC18YJL037W 675 nt5.39□□□□□ -1.55 RIP-Chip
PCS60P38137 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt5.39□□□□□ -1.55
PCS60P38137 TVP18YMR071C 504 nt5.39□□□□□ -1.55
PCS60P38137 YOR302WYOR302W 78 nt5.39□□□□□ -1.55
PCS60P38137 YPL142CYPL142C 318 nt5.39□□□□□ -1.55
PCS60P38137 VIK1YPL253C 1944 nt5.38□□□□□ -1.55
PCS60P38137 BYE1YKL005C 1785 nt5.38□□□□□ -1.55
PCS60P38137 YER088C-AYER088C-A 324 nt5.38□□□□□ -1.55
PCS60P38137 HSK3YKL138C-A 210 nt5.38□□□□□ -1.55
PCS60P38137 SAP30YMR263W 606 nt5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.7 ms