Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPARGP37231 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPARGP37231 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPARGP37231 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPARGP37231 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPARGP37231 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPARGP37231 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPARGP37231 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPARGP37231 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPARGP37231 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPARGP37231 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPARGP37231 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPARGP37231 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPARGP37231 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PPARGP37231 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PPARGP37231 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPARGP37231 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPARGP37231 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPARGP37231 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPARGP37231 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPARGP37231 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPARGP37231 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPARGP37231 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPARGP37231 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPARGP37231 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPARGP37231 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPARGP37231 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPARGP37231 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPARGP37231 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPARGP37231 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPARGP37231 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPARGP37231 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPARGP37231 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPARGP37231 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPARGP37231 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPARGP37231 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPARGP37231 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPARGP37231 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPARGP37231 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PPARGP37231 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPARGP37231 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPARGP37231 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPARGP37231 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPARGP37231 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPARGP37231 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPARGP37231 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPARGP37231 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPARGP37231 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPARGP37231 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPARGP37231 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPARGP37231 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPARGP37231 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPARGP37231 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPARGP37231 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPARGP37231 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPARGP37231 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPARGP37231 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPARGP37231 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPARGP37231 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPARGP37231 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPARGP37231 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPARGP37231 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPARGP37231 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPARGP37231 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPARGP37231 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPARGP37231 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPARGP37231 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPARGP37231 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPARGP37231 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPARGP37231 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPARGP37231 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPARGP37231 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPARGP37231 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGP37231 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGP37231 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms