Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BRS3P32247 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRS3P32247 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BRS3P32247 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRS3P32247 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRS3P32247 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRS3P32247 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRS3P32247 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRS3P32247 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRS3P32247 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRS3P32247 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRS3P32247 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRS3P32247 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRS3P32247 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRS3P32247 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRS3P32247 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRS3P32247 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRS3P32247 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRS3P32247 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRS3P32247 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRS3P32247 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRS3P32247 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRS3P32247 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRS3P32247 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRS3P32247 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRS3P32247 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRS3P32247 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRS3P32247 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRS3P32247 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRS3P32247 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRS3P32247 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRS3P32247 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRS3P32247 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRS3P32247 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRS3P32247 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRS3P32247 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRS3P32247 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRS3P32247 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRS3P32247 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRS3P32247 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRS3P32247 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRS3P32247 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRS3P32247 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRS3P32247 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRS3P32247 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRS3P32247 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRS3P32247 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRS3P32247 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRS3P32247 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BRS3P32247 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms