Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX1P32242 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX1P32242 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX1P32242 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX1P32242 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX1P32242 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX1P32242 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX1P32242 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX1P32242 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX1P32242 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX1P32242 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX1P32242 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX1P32242 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX1P32242 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX1P32242 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX1P32242 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX1P32242 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX1P32242 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX1P32242 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX1P32242 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX1P32242 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX1P32242 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX1P32242 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX1P32242 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX1P32242 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX1P32242 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX1P32242 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX1P32242 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX1P32242 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX1P32242 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX1P32242 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX1P32242 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX1P32242 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX1P32242 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX1P32242 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTX1P32242 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTX1P32242 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTX1P32242 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTX1P32242 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTX1P32242 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTX1P32242 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTX1P32242 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTX1P32242 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTX1P32242 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX1P32242 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTX1P32242 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTX1P32242 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTX1P32242 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTX1P32242 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTX1P32242 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTX1P32242 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTX1P32242 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTX1P32242 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
OTX1P32242 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTX1P32242 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTX1P32242 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTX1P32242 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTX1P32242 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTX1P32242 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTX1P32242 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTX1P32242 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
OTX1P32242 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms