Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms