Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5DP30049 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5DP30049 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5DP30049 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5DP30049 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP5DP30049 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5DP30049 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP5DP30049 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5DP30049 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5DP30049 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5DP30049 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5DP30049 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5DP30049 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5DP30049 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5DP30049 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5DP30049 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5DP30049 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5DP30049 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5DP30049 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5DP30049 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5DP30049 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5DP30049 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5DP30049 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5DP30049 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5DP30049 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5DP30049 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5DP30049 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5DP30049 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5DP30049 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5DP30049 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5DP30049 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5DP30049 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5DP30049 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5DP30049 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5DP30049 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5DP30049 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5DP30049 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5DP30049 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP5DP30049 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP5DP30049 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5DP30049 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5DP30049 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5DP30049 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5DP30049 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5DP30049 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5DP30049 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5DP30049 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5DP30049 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5DP30049 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5DP30049 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5DP30049 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5DP30049 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5DP30049 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5DP30049 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5DP30049 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5DP30049 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP5DP30049 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5DP30049 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5DP30049 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5DP30049 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5DP30049 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5DP30049 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5DP30049 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5DP30049 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5DP30049 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5DP30049 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms