Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RBL1P28749 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RBL1P28749 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RBL1P28749 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBL1P28749 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RBL1P28749 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBL1P28749 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBL1P28749 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBL1P28749 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBL1P28749 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBL1P28749 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RBL1P28749 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RBL1P28749 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RBL1P28749 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBL1P28749 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBL1P28749 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBL1P28749 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBL1P28749 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RBL1P28749 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBL1P28749 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBL1P28749 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RBL1P28749 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBL1P28749 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RBL1P28749 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RBL1P28749 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RBL1P28749 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBL1P28749 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RBL1P28749 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBL1P28749 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBL1P28749 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RBL1P28749 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RBL1P28749 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RBL1P28749 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RBL1P28749 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBL1P28749 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBL1P28749 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBL1P28749 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBL1P28749 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBL1P28749 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RBL1P28749 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RBL1P28749 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RBL1P28749 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RBL1P28749 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RBL1P28749 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RBL1P28749 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBL1P28749 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBL1P28749 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBL1P28749 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBL1P28749 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBL1P28749 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RBL1P28749 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBL1P28749 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBL1P28749 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RBL1P28749 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RBL1P28749 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RBL1P28749 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RBL1P28749 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBL1P28749 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBL1P28749 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms