Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms