Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD1P28340 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD1P28340 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD1P28340 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD1P28340 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD1P28340 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD1P28340 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD1P28340 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD1P28340 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD1P28340 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD1P28340 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD1P28340 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD1P28340 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD1P28340 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD1P28340 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD1P28340 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD1P28340 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD1P28340 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD1P28340 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD1P28340 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD1P28340 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD1P28340 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD1P28340 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD1P28340 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLD1P28340 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLD1P28340 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLD1P28340 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLD1P28340 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLD1P28340 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLD1P28340 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLD1P28340 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLD1P28340 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLD1P28340 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLD1P28340 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLD1P28340 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLD1P28340 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLD1P28340 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD1P28340 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD1P28340 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD1P28340 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD1P28340 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD1P28340 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD1P28340 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD1P28340 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD1P28340 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD1P28340 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD1P28340 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD1P28340 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD1P28340 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD1P28340 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD1P28340 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLD1P28340 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLD1P28340 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
POLD1P28340 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLD1P28340 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
POLD1P28340 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
POLD1P28340 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLD1P28340 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLD1P28340 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLD1P28340 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLD1P28340 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD1P28340 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD1P28340 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD1P28340 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD1P28340 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD1P28340 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD1P28340 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD1P28340 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD1P28340 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD1P28340 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD1P28340 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD1P28340 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD1P28340 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD1P28340 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD1P28340 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD1P28340 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD1P28340 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD1P28340 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD1P28340 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD1P28340 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD1P28340 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD1P28340 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD1P28340 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD1P28340 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD1P28340 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD1P28340 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD1P28340 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD1P28340 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD1P28340 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD1P28340 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD1P28340 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD1P28340 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD1P28340 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD1P28340 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD1P28340 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD1P28340 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD1P28340 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD1P28340 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD1P28340 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD1P28340 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms