Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms