Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTFRP26992 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms