Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms