Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms