Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms