Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A1P13866 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms