Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKBP12277 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKBP12277 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKBP12277 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKBP12277 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKBP12277 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKBP12277 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKBP12277 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CKBP12277 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKBP12277 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKBP12277 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKBP12277 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKBP12277 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKBP12277 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKBP12277 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CKBP12277 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKBP12277 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKBP12277 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKBP12277 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKBP12277 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKBP12277 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKBP12277 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKBP12277 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKBP12277 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKBP12277 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKBP12277 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKBP12277 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKBP12277 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKBP12277 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CKBP12277 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CKBP12277 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKBP12277 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKBP12277 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKBP12277 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CKBP12277 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKBP12277 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKBP12277 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKBP12277 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKBP12277 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKBP12277 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKBP12277 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKBP12277 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKBP12277 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKBP12277 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKBP12277 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKBP12277 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKBP12277 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKBP12277 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKBP12277 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKBP12277 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKBP12277 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKBP12277 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKBP12277 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKBP12277 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKBP12277 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKBP12277 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKBP12277 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKBP12277 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKBP12277 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKBP12277 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKBP12277 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKBP12277 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms