Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD3P0DMS9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms