Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms