Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I0

USP17L8, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L8P0C7I0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L8P0C7I0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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