Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTAP09496 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTAP09496 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTAP09496 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTAP09496 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTAP09496 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTAP09496 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTAP09496 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTAP09496 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTAP09496 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTAP09496 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTAP09496 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTAP09496 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTAP09496 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTAP09496 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTAP09496 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTAP09496 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTAP09496 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTAP09496 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTAP09496 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTAP09496 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTAP09496 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTAP09496 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTAP09496 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTAP09496 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTAP09496 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTAP09496 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTAP09496 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTAP09496 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTAP09496 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTAP09496 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTAP09496 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTAP09496 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTAP09496 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTAP09496 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTAP09496 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTAP09496 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTAP09496 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTAP09496 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTAP09496 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTAP09496 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTAP09496 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTAP09496 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTAP09496 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTAP09496 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTAP09496 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTAP09496 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTAP09496 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTAP09496 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTAP09496 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTAP09496 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTAP09496 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTAP09496 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTAP09496 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTAP09496 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTAP09496 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTAP09496 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTAP09496 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTAP09496 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTAP09496 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTAP09496 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTAP09496 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTAP09496 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTAP09496 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTAP09496 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLTAP09496 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTAP09496 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTAP09496 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTAP09496 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTAP09496 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTAP09496 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTAP09496 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTAP09496 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTAP09496 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTAP09496 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTAP09496 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTAP09496 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTAP09496 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTAP09496 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTAP09496 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTAP09496 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTAP09496 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTAP09496 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTAP09496 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTAP09496 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTAP09496 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTAP09496 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTAP09496 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTAP09496 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTAP09496 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTAP09496 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTAP09496 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTAP09496 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTAP09496 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTAP09496 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTAP09496 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTAP09496 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTAP09496 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTAP09496 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTAP09496 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms