Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALB1P05937 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALB1P05937 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALB1P05937 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALB1P05937 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALB1P05937 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALB1P05937 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALB1P05937 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALB1P05937 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALB1P05937 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALB1P05937 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALB1P05937 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALB1P05937 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALB1P05937 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CALB1P05937 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALB1P05937 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALB1P05937 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CALB1P05937 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALB1P05937 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALB1P05937 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALB1P05937 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALB1P05937 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALB1P05937 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALB1P05937 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALB1P05937 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALB1P05937 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALB1P05937 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALB1P05937 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALB1P05937 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CALB1P05937 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALB1P05937 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CALB1P05937 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALB1P05937 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALB1P05937 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALB1P05937 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALB1P05937 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALB1P05937 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALB1P05937 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALB1P05937 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALB1P05937 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALB1P05937 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALB1P05937 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALB1P05937 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALB1P05937 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALB1P05937 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALB1P05937 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALB1P05937 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALB1P05937 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALB1P05937 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALB1P05937 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALB1P05937 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALB1P05937 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALB1P05937 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALB1P05937 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALB1P05937 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALB1P05937 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALB1P05937 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALB1P05937 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CALB1P05937 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALB1P05937 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALB1P05937 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALB1P05937 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALB1P05937 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALB1P05937 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALB1P05937 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CALB1P05937 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALB1P05937 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALB1P05937 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALB1P05937 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALB1P05937 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALB1P05937 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALB1P05937 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALB1P05937 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALB1P05937 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALB1P05937 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALB1P05937 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALB1P05937 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALB1P05937 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms