Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A1P05023 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A1P05023 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms