Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4AP04350 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms