Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF6BO95407 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms