Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms