Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC22O60826 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC22O60826 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC22O60826 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC22O60826 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC22O60826 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC22O60826 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC22O60826 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC22O60826 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC22O60826 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC22O60826 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC22O60826 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC22O60826 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC22O60826 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms