Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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