Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCO2O43819 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCO2O43819 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCO2O43819 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCO2O43819 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCO2O43819 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCO2O43819 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCO2O43819 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCO2O43819 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCO2O43819 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCO2O43819 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCO2O43819 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCO2O43819 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCO2O43819 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCO2O43819 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCO2O43819 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCO2O43819 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCO2O43819 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCO2O43819 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCO2O43819 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCO2O43819 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCO2O43819 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCO2O43819 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCO2O43819 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCO2O43819 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCO2O43819 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCO2O43819 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCO2O43819 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCO2O43819 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCO2O43819 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCO2O43819 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCO2O43819 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCO2O43819 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCO2O43819 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCO2O43819 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCO2O43819 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCO2O43819 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCO2O43819 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCO2O43819 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCO2O43819 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCO2O43819 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCO2O43819 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCO2O43819 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCO2O43819 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCO2O43819 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCO2O43819 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCO2O43819 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCO2O43819 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCO2O43819 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCO2O43819 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCO2O43819 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCO2O43819 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCO2O43819 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCO2O43819 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCO2O43819 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCO2O43819 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCO2O43819 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCO2O43819 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCO2O43819 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCO2O43819 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCO2O43819 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCO2O43819 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCO2O43819 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCO2O43819 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCO2O43819 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCO2O43819 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCO2O43819 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCO2O43819 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCO2O43819 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SCO2O43819 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCO2O43819 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCO2O43819 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCO2O43819 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCO2O43819 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCO2O43819 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCO2O43819 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCO2O43819 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms