Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms