Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF6O14896 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF6O14896 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF6O14896 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF6O14896 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF6O14896 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF6O14896 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF6O14896 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF6O14896 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF6O14896 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF6O14896 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF6O14896 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF6O14896 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF6O14896 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF6O14896 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF6O14896 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF6O14896 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF6O14896 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF6O14896 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF6O14896 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF6O14896 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF6O14896 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF6O14896 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF6O14896 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF6O14896 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF6O14896 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF6O14896 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF6O14896 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF6O14896 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF6O14896 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF6O14896 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF6O14896 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF6O14896 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF6O14896 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF6O14896 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF6O14896 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRF6O14896 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF6O14896 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF6O14896 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF6O14896 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF6O14896 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF6O14896 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF6O14896 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF6O14896 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF6O14896 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF6O14896 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF6O14896 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF6O14896 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF6O14896 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF6O14896 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF6O14896 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF6O14896 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF6O14896 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF6O14896 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF6O14896 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF6O14896 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF6O14896 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF6O14896 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF6O14896 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms