Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTLL13PA6NNM8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms