Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNDIG1LA6NDD5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYNDIG1LA6NDD5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms