Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GMNCA6NCL1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GMNCA6NCL1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms