Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1E9

TRBV7-7, T-cell receptor beta variable 7-7 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-7A0A0K0K1E9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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