Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 ETFRF1-203ENST00000554266 429 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 CIDEB-203ENST00000554411 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 NDUFB10P2-201ENST00000568872 478 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 TCF4-245ENST00000570177 1872 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 RN7SL122P-201ENST00000579362 301 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 LINC00909-202ENST00000580048 3463 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 NAPGP1-201ENST00000603818 719 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 OR7E108P-201ENST00000605227 991 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 SMIM8-206ENST00000608353 2111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 NOMO2-210ENST00000620440 1360 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ZNF700-203ENST00000622593 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL031719.2-201ENST00000624488 476 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC139099.4-201ENST00000625083 3504 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC245166.3-201ENST00000636897 257 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 NECAP1-219ENST00000639811 2175 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 DPCR1-203ENST00000636043 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 MICAL3-204ENST00000414725 4756 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 L3MBTL4-202ENST00000400104 4534 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 URGCP-202ENST00000402306 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 SEMA4A-205ENST00000368286 3135 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 RAD17-205ENST00000354868 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 RPL32P3-206ENST00000510078 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ADCY5-210ENST00000491190 3962 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 CCNY-204ENST00000374706 3940 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 FGFR1-209ENST00000397113 3680 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC139700.1-201ENST00000605810 1540 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 C12orf43-201ENST00000288757 4469 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 TNFSF14-201ENST00000245912 4336 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ANXA10-201ENST00000359299 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC012640.4-201ENST00000606194 2550 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 IL2RA-201ENST00000256876 1006 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AL450998.1-201ENST00000321418 438 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 PCP4-201ENST00000328619 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 MIR210-201ENST00000362168 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 RN7SKP231-201ENST00000363281 277 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 NCR2-202ENST00000373086 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 NCR2-203ENST00000373089 942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 CEACAM21-202ENST00000401445 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 PPIAP29-201ENST00000414949 499 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 PPP1R2P1-210ENST00000429032 618 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AL512306.3-201ENST00000453895 683 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 PHBP12-201ENST00000453979 811 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 KCNAB1-AS2-201ENST00000473876 538 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC024940.2-201ENST00000495623 606 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC091917.3-201ENST00000509496 600 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC233724.5-201ENST00000509526 598 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC007036.3-201ENST00000511893 614 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 RPL30-209ENST00000521291 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 IL32-216ENST00000529699 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 DBI-208ENST00000535617 654 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AP001453.2-202ENST00000538355 431 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 IL32-225ENST00000548246 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 LINC01579-203ENST00000555023 400 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC010186.4-201ENST00000573622 615 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC006441.4-201ENST00000583161 636 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AP005482.3-201ENST00000585877 720 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AP001995.2-201ENST00000602773 897 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AP000322.2-201ENST00000608289 510 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 SVIL-AS1-211ENST00000609413 566 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC132216.1-201ENST00000610375 1158 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 SLC25A44-202ENST00000423538 3662 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 EGF-201ENST00000265171 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 CHRNA6-201ENST00000276410 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ERICH6B-201ENST00000298738 2421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 NSUN7-201ENST00000316607 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 MTSS1-202ENST00000378017 4458 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ACOX1-202ENST00000301608 2215 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 NFASC-207ENST00000404907 5447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ERBB2-204ENST00000541774 4341 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 SH3TC2-215ENST00000515425 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC099792.1-202ENST00000635290 2012 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AP000977.1-201ENST00000501964 2908 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ADCY1-201ENST00000297323 12503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 FUT10-201ENST00000327671 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 TNFAIP3-208ENST00000615468 3818 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ARHGEF9-202ENST00000374870 4644 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ZNF571-AS1-201ENST00000585578 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 PRPF38B-203ENST00000370025 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 MYT1L-203ENST00000407844 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 CORO2B-203ENST00000543950 3611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC078925.4-201ENST00000623737 1717 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 MDH1-201ENST00000233114 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 CNTNAP2-201ENST00000361727 9896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ASTN1-204ENST00000424564 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 CASP4-203ENST00000444739 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 CCND2-201ENST00000261254 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 AC008663.2-202ENST00000519897 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 LINC00994-201ENST00000485805 2129 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 ST3GAL6-201ENST00000265261 3362 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 NBPF7-201ENST00000445758 1326 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 OR6C66P-203ENST00000641469 4627 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 C9orf84-202ENST00000374283 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 OR10G6-201ENST00000307002 999 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LMO3Q8TAP4 PILRA-203ENST00000394000 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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