Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms