Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LEMD3Q9Y2U8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms