Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.87■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC48.87■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.87■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC48.87■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC48.87■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC48.87■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC48.87■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC48.87■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC48.87■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC48.86■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC48.86■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC48.86■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.86■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.86■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC48.85■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC48.85■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC48.85■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.84■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC48.83■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC48.83■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC48.83■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC48.82■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC48.82■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC48.82■■■■■ 5.41
NISCHQ9Y2I1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.81■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC48.8■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC48.79■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC48.79■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC48.79■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.79■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.78■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC48.78■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC48.78■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.78■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC48.78■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC48.78■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC48.77■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC48.77■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC48.77■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC48.77■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC48.77■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.76■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC48.76■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC48.75■■■■■ 5.4
NISCHQ9Y2I1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.75■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC48.75■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.75■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC48.75■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC48.75■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC48.74■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.74■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC48.74■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC48.74■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC48.74■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC48.74■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC48.73■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC48.73■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC48.73■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
NISCHQ9Y2I1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC48.73■■■■■ 5.39
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