Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DTX4Q9Y2E6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms