Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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