Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX6Q9UNH7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX6Q9UNH7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX6Q9UNH7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX6Q9UNH7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX6Q9UNH7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX6Q9UNH7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX6Q9UNH7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX6Q9UNH7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX6Q9UNH7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX6Q9UNH7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms