Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms