Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MED23Q9ULK4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MED23Q9ULK4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MED23Q9ULK4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MED23Q9ULK4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MED23Q9ULK4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MED23Q9ULK4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MED23Q9ULK4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MED23Q9ULK4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MED23Q9ULK4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms