Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms