Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXW11Q9UKB1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms