Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP21Q9UK80 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms